جدول ۲-۳ ترکیبات TE 40
جدول ۲-۴ شرایط PCR 45
جدول ۲-۵ تنظیمات دستگاه ABI3130 در جداسازی قطعات STR 46
شکل۲-۴ چگونگی عملکرد دستگاه الکتروفورز موئینهای[۲۶] ۴۷
جدول ۲-۶ مواد فلورسنت موجود در کیت ABI و رنگهایشان ۴۸
شکل۲-۵ مواد مختلف در طول موجهای متفاوتی نور خود را ساطع میکنند[۲۶] ۴۸
جدول ۲-۷ ماده فلورسنت مورد استفاده برای هر جایگاه[۲۵] ۴۹
شکل۳-۱ پروفایل ژنتیکی یک فرد ۵۴
جدول۳- ۲ فراوانی آللی و سایر پارامترهای جمعیتی و پزشکیقانونی در جمعیت یزد را نشان میدهد. ۶۰
جدول ۴-۱ مقایسه جمعیت کرمانشاه با سایر جمعیتها ۶۷
جدول ۴-۲ مقایسه جمعیت یزد با سایر جمعیتها ۶۸
فهرست شکلها
شکل ۱-۲ کراسینگآور و مبادلات نابرابر بین کروماتیدهای خواهری سبب ایجاد حذفشدگی یا الحاق میشود]۲۳٫[ ۱۷
شکل ۱-۳ متزلزل بودن پلیمراز حین همانندسازی DNA میتواند طول تکرار را به اندازه یک یا دو واحد تغییر دهد [۲۳]. ۱۸
شکل ۱-۴ آللهای فرزندان مجموعهای از آللهای والدین آنها میباشد [۶۲]. ۲۱
شکل ۱-۵ شناسائی مجرمین به کمک مارکرهای STR[26]. 23
شکل ۱-۶ مراحل انگشتنگاری ژنتیکی [۳۸]. ۲۸
شکل ۱-۷ مراحل پروفایلینگ DNA[36]. 30
شکل ۱-۸ جایگاههای CODIS روی کروموزومهای انسان[۲۵]. ۳۲
شکل ۱-۹ موقعیت جغرافیائی استان کرمانشاه [۴۴]. ۳۵
شکل ۱-۱۰ موقعیت جغرافیائی استان یزد[۴۵]. ۳۶
شکل۲-۲ استفاده از Multiplex PCR در روش پروفایلینگ[۳۶] ۴۴
شکل ۲-۳ دستگاه الکتروفورز موئینه ای[۵۱] ۴۶
شکل ۲-۶ladder بهکاررفته در کیت ABI[25] 50
شکل ۴-۱ درخت فیلوژنتیکی میان سیزده جمعیت مختلف[۴۶] ۷۱
شکل ۴-۲٫درخت فیلوژنتیکی میان نه جمعیت مختلف[۴۶] ۷۱
فهرست نمودارها
نمودار۳-۱ پارامترهای ژنتیکی جمعیت استان کرمانشاه برحسب درصد ۶۰
نمودار۳-۲ پارامترهای ژنتیک جمعیت استان یزد برحسب درصد ۶۴
چکیده
بررسی تنوع ژنتیکی اقوام ایرانی با بهره گرفتن از STR مونا داودبیگی |
بررسی تنوع ژنتیکی در جمعیتها با استفاده ار تعیین فراوانی آللی و پارامترهای ژنتیکی روش نوینی است که در سالهای گذشته در بسیاری از جمعیتهای جهان صورت گرفته و با بهره گرفتن از آن شباهت بسیاری از جمعیتها به یکدیگر مشخص گردیده. شباهت جمعیتها نشاندهندهی همسانبودن خزانهی ژنتیکی آنها و احتمالا یکسانبودن آن جمعیتها در گذشته است. پس این احتمال وجود دارد که این جمعیتها در گذشته یک جمعیت بوده باشند و بعدها به دلایل جغرافیایی و یا مهاجرتها از یکدیگر جدا شده باشند. یکی از راههای بررسی تنوع ژنتیکی در جمعیتها استفاده از توالیهای کوتاه تکراری میباشد .هدف این مطالعه بررسی تنوع ژنتیکی در دو قوم یزد و کرد (کرمانشاه) از ایران بود. بدین منظور پروفایل ژنتیکی پنجاه فرد غیرخویشاوند از هر یک از جمعیتهای کرمانشاه و یزد با بهره گرفتن از کیت ABIتهیه شد. این کیت حاوی پانزده جایگاه D8S1179،D21S11 ، D7S820،CSF ،D3S1358 ،TH01 ، D13S317، D16S539،D2S1338 ، D19S433، VWA، TPOX،D18S51 ، D5S818،FGA ،VWA ، TPOX و TH01 و ژن آمیلوژنین (برای تعیین جنسیت افراد) میباشد. نتایج نشاندادند که به جز دو جایگاه D7S820 وD19S433 در جمعیت کرمانشاه و سه جایگاه D21S11 ,D19S433 و VWA در یزد سایر جایگاهها در تعادل هاردیواینبرگ بودند. همچنین پارامترهای پزشکیقانونی شامل PIC,PD,PE,MP در این مطالعه بررسی شدند. سپس دو جمعیت با جمعیتهای کشورهای همسایه مقایسه شدند. این مطالعه نشان داد که این جایگاهها، جایگاههای مناسب برای استفاده در تستهای تعیین هویت و مطالعات جمعیتی میباشند. در نتیجهی مقایسات هم دیده شد که هر دو جمعیت یزد و کرمانشاه شباهت زیادی به جمعیت کشور ترکیه داشتند ولی با سایر کشورها متفاوت بودند. از طرفی یزد نسبت به کرمانشاه دارای جمعیت همگنتری بود که این مسئله میتواند بهعلت بکر بودن این جمعیت در طول سالیان مختلف باشد.
کلمات کلیدی: توالیهای کوتاه تکراری، نشانگرهای مولکولی، ژنتیک جمعیت
Abstract
Genetic variation in two Iranian population with STR Mona Davood Beigi |